Назва #Cisco — скорочення від назви міста Сан-Франциско, штат Каліфорнія (San Francisco).

Раніше, коли засновники вибирали для компанії назву, вони часто потрапляли на імена, які вже зайняті або використовуються.

Врешті-решт хтось запропонував назву «cisco» з першою маленькою буквою «c» (вже існувала компанія з назвою «CISCO»).

Існує версія, згідно з якою первинна назва компанії звучала і писалася саме як San-Francisco Systems, але в процесі реєстрації незграбний рух адвоката (або нотаріуса) привів до надриву титульного листа з назвою компанії. Майбутні власники визнали це за знак і зафіксували назву cisco Systems з маленької букви.

Ім'я ciscoSystems (з маленькою «c») продовжувало використовуватися в спільноті інженерів компанії ще довго після того, як компанія офіційно змінила ім'я на Cisco Systems, Inc. Назву «ciscoSystems» досі можна зустріти в повідомленнях Cisco IOS і звітах про помилки.

Логотипом компанії є стилізоване зображення моста «Золоті ворота».